脑洞悲和脑洞喜所居住的小镇最近常发生一些案件，这天，桶亩队长家的羊突然失踪，因为父亲很看中这只羊，桶亩想法设法想找回羊。他急忙去寻找朋友来帮忙，最后经过朋友的一番分析推理，终于成功找回了羊，羊虽然找回来了，接下来却发生了一系列案件。

全能侦探，百分百破案！蓝玲市知名的金探长突然神秘失踪！司令官派出迷你特工队火速前往调查，却发现惊天秘密，原来金探长遭到“反派联盟”的暗算，从一米八的潇洒帅哥变成了一个8岁小孩！金探长虽保持着大人的心智，却顶着一副小孩的皮囊，只好请求迷你特工队留下帮忙和保护。通过一系列的案件调查，迷你特工队从中学会了案件重演、侦探工具搜查、动物咨询等不同的侦探技能，赢得了侦探宝石和各种奖励！迷你特工队都朝着成为全能侦探而不断努力！